Al in augustus was voor het personeel van het Paard van Troje duidelijk dat hun directeur zou vertrekken. Maar als Jonker door journalisten werd gevraagd om commentaar hulde hij zich in stilzwijgen. Zo schreef de internetsite Haags Pop Podium op 30 augustus: 'Directeur Pim Jonker van het Paard van Troje ontkent dat hij weg wil bij het popcentrum. In een reactie op de aanhoudende geruchten over zijn vertrek per april 2004 zegt Jonker dat hij niet van plan is om tot z'n 65e directeur te blijven maar dat hij nu nog niet op zoek is naar een andere baan.' Jonker trad in februari 1995 in dienst bij het Paard als opvolger van Herbert Boerendonk die toen directeur van theater Diligentia werd. Een reden voor de geheimzinnigheid in augustus wil Jonker niet geven. Maar nadat afgelopen zaterdag het bestuur van het popcentrum een advertentie plaatste voor een nieuwe directeur, heeft ontkennen geen zin meer. Als reden voor zijn vertrek zegt Jonker: "Mijn klus was klaar. Mijn eerste opdracht was de nieuwbouw van het Paard. De tweede opdracht was het opzetten van de organisatie. De nieuwbouw is inmiddels klaar. De organisatie staat in de basis maar is nog niet helemaal afgerond. Mensen worden nu heel erg overbelast. Er moet eigenlijk meer personeel bij." De directeur geeft verder toe dat de veranderde doelstellingen van het Paard van Troje zijn vertrek hebben bespoedigd. "Het Paard heeft sinds de voltooiing van de nieuwbouw zeer hoge vaste lasten. We kunnen ons eigenlijk geen slecht bezochte concerten meer veroorloven. De kosten moeten terugverdiend worden met een programmering die veel publiek trekt. Met die markt heb ik niet zoveel." Met een wrange glimlach heeft Jonker de advertentie in de Volkskrant gelezen. "De verschillen met de advertentie waarop ik heb gereageerd zijn heel erg groot. Destijds zocht men iemand met een artistiek inhoudelijke visie en affiniteit met popmuziek. Nu zoekt met een 'cultureel ondernemer'. Let wel, 'cultureel' is hier een bijvoeglijk naamwoord. Ik vind ook dat het centrum zo'n persoon nodig heeft, maar het is wel tekenend voor de nieuwe situatie." Op 1 april vertrekt Pim Jonker bij het Paard van Troje. Zijn opvolger zal in de maand daarvoor nog door hem worden ingewerkt. Ook in de jaren daarna zal de invloed van Jonker merkbaar blijven. "Mijn laatste klus was het schrijven van het Kunstenplan 2005 – 2008. In dat stuk hamer ik op de rol van het Paard voor experimentele muziek en beginnende bandjes." Wat Jonker na 1 april gaat doen is nog onduidelijk. "Ik heb een aantal leuke aanbiedingen, maar ik overweeg ook om een sabbatical halfjaar te nemen. Ik heb hiervoor nooit langer dan drie jaar voor een bedrijf gewerkt." Over zijn afscheidsfeest heeft de Amsterdammer wel nagedacht. "Ik zou het leuk vinden als Nick Cave komt spelen, maar de Rolling Stones mag ook."